Transcriptomic approaches are increasingly used in reproductive medicine to identify candidate endometrial biomarkers. However, it is known that endometrial progression in the molecular biology of the menstrual cycle is a main factor that could affect the discovery of disorder-related genes. Therefore, the aim of this study was to systematically review current practices for considering the menstrual cycle effect and to demonstrate its bias in the identification of potential biomarkers. From the 35 studies meeting the criteria, 31.43% did not register the menstrual cycle phase. We analysed the menstrual cycle effect in 11 papers (including 12 studies) from Gene Expression Omnibus: three evaluating endometriosis, two evaluating recurrent implantation failure, one evaluating recurrent pregnancy loss, one evaluating uterine fibroids and five control studies, which collected endometrial samples throughout menstrual cycle. An average of 44.2% more genes were identified after removing menstrual cycle bias using linear models. This effect was observed even if studies were balanced in the proportion of samples collected at different endometrial stages or only in the mid-secretory phase. Our bias correction method increased the statistical power by retrieving more candidate genes than per-phase independent analyses. Thanks to this practice, we discovered 544 novel candidate genes for eutopic endometriosis, 158 genes for ectopic ovarian endometriosis and 27 genes for recurrent implantation failure. In conclusion, we demonstrate that menstrual cycle progression masks molecular biomarkers, provides new guidelines to unmask them and proposes a new classification that distinguishes between biomarkers of disorder or/and menstrual cycle progression.

Améliorer La compréhension de la douleur pelvienne chronique (DPC) et fournir des directives cliniques factuelles qui bénéficieront aux fournisseurs de soins de santé primaires, aux obstétriciens-gynécologues et aux spécialistes de la douleur chronique.
La DPC est une pathologie débilitante courante qui affecte les femmes. Elle est à l\'origine d\'importantes souffrances personnelles et de dépenses de santé considérables associées aux interventions, dont de multiples consultations et un grand nombre de traitements médicaux et chirurgicaux. Puisque la pathophysiologie sous-jacente de cet état pathologique complexe est mal comprise, ces traitements n\'ont obtenu que des taux de réussite variables.
Efficacité des options diagnostiques et thérapeutiques (y compris l\'évaluation du dysfonctionnement myofascial); soins multidisciplinaires; un modèle de réadaptation mettant l\'accent sur l\'obtention d\'un fonctionnement supérieur malgré la présence d\'une certaine douleur (plutôt que de chercher à obtenir une guérison totale); et utilisation appropriée des opiacés pour le soulagement de la douleur chronique.
Des recherches ont été menées dans Medline et la base de données Cochrane en vue d\'en tirer les articles de langue anglaise, publiés entre 1982 et 2004, portant sur des sujets liés à la DPC, dont la gestion des soins actifs, le dysfonctionnement myofascial et les options thérapeutiques médicales et chirurgicales. Les membres du comité ont analysé la littérature pertinente, ainsi que les données disponibles tirées d\'une évaluation des besoins des personnes présentant une DPC; ils ont fait appel à une approche de consensus pour l\'élaboration des recommandations.
La qualité des résultats a été évaluée au moyen des critères décrits dans le rapport du Groupe d\'étude canadien sur l\'examen médical périodique. Les recommandations visant la pratique ont été classées conformément à la méthode décrite dans ce rapport (Tableau 1).
Les recommandations visent ce qui suit : (a) compréhension des besoins des femmes présentant une DPC ; (b) évaluation clinique générale ; (c) évaluation pratique des niveaux de douleur ; (d) douleur myofasciale ; (e) médicaments et interventions chirurgicales ; (f) principes de la gestion des opiacés; (g) utilisation accrue de l\'imagerie par résonance magnétique (IRM) ; (h) documentation de l\'étendue de La maladie constatée au moyen de la chirurgie ; (i) thérapies non conventionnelles; (j) accès à des modèles de soins multidisciplinaires faisant appel à des composantes de physiothérapie (comme l\'exercice et la posture) et de psychologie (comme La thérapie cognitivo- comportementale), conjointement avec d\'autres disciplines médicales, telles que La gynécologie et l\'anesthésie ; (k) attention accrue portée à La DPC dans La formation des professionnels de La sante ; et (l) attention accrue portée à la DPC dans le domaine des recherches officielles et de haut calibre. Le comité recommande que les ministères provinciaux de La Sante prennent des mesures en faveur de la création d\'équipes multidisciplinaires pouvant assurer La prise en charge de cette pathologie. Chapitre 2 : Portee et definition de La douleur pelvienne chronique Chapitre 3 : Anamnese, examen physique et évaluation psychologique Chapitre 4 : Explorations Chapitre 5 : Sources de douleur pelvienne chronique Chapitre 6 : Causes urologiques et gastro-intestinales de La douleur pelvienne chronique Chapitre 7 : Dysfonctionnement myofasclal Chapitre 8 : Therapie medicale - résultats en matiere d\'efficacite Chapitre 9 : Chirurgie - résultats en matiere d\'efficacite Chapitre 11 : Prise en charge multidisciplinaire de La douleur chronique Chapitre 14 : Orientations futures.

To improve the understanding of chronic pelvic pain (CPP) and to provide evidence-based guidelines of value to primary care health professionals, general obstetricians and gynaecologists, and those who specialize in chronic pain.
CPP is a common, debilitating condition affecting women. It accounts for substantial personal suffering and health care expenditure for interventions, including multiple consultations and medical and surgical therapies. Because the underlying pathophysiology of this complex condition is poorly understood, these treatments have met with variable success rates.
Effectiveness of diagnostic and therapeutic options, including assessment of myofascial dysfunction, multidisciplinary care, a rehabilitation model that emphasizes achieving higher function with some pain rather than a cure, and appropriate use of opiates for the chronic pain state.
Medline and the Cochrane Database from 1982 to 2004 were searched for articles in English on subjects related to CPP, including acute care management, myofascial dysfunction, and medical and surgical therapeutic options. The committee reviewed the literature and available data from a needs assessment of subjects with CPP, using a consensus approach to develop recommendations.
The quality of the evidence was rated using the criteria described in the Report of the Canadian Task Force on the Periodic Health Examination. Recommendations for practice were ranked according to the method described in that report (Table 1).
The recommendations are directed to the following areas: (a) an understanding of the needs of women with CPP; (b) general clinical assessment; (c) practical assessment of pain levels; (d) myofascial pain; (e) medications and surgical procedures; (d) principles of opiate management; (f) increased use of magnetic resonance imaging (MRI); (g) documentation of the surgically observed extent of disease; (h) alternative therapies; (i) access to multidisciplinary care models that have components of physical therapy (such as exercise and posture) and psychology (such as cognitive-behavioural therapy), along with other medical disciplines, such as gynaecology and anesthesia; G) increased attention to CPP in the training of health care professionals; and (k) increased attention to CPP in formal, high-calibre research. The committee recommends that provincial ministries of health pursue the creation of multidisciplinary teams to manage the condition.