Abstract:
Lumpy skin disease virus (LSDV) is the causative agent of an economically important cattle disease which is notifiable to the World Organisation for Animal Health. Over the past decades, the disease has spread at an alarming rate throughout the African continent, the Middle East, Eastern Europe, the Russian Federation, and many Asian countries. While multiple LDSV whole genomes have made further genetic comparative analyses possible, knowledge on the protein composition of the LSDV particle remains lacking. This study provides for the first time a comprehensive proteomic analysis of an infectious LSDV particle, prompting new efforts toward further proteomic LSDV strain characterization. Furthermore, this first incursion within the capripoxvirus proteome represents one of very few proteomic studies beyond the sole Orthopoxvirus genus, for which most of the proteomics studies have been performed. Providing new information about other chordopoxviruses may contribute to shedding new light on protein composition within the Poxviridae family.
摘要:
块状皮肤病(LSD)病毒,一种羊痘病毒属的反刍动物痘病毒,是一种经济上重要的牛疾病的病原体,被世界动物卫生组织归类为应报告的疾病。大型且复杂的包膜LSD病毒(LSDV)颗粒包围了151kbp的双链线性DNA基因组,包括156个预测的ORF,以及各种尚未鉴定的蛋白质。在LSD最近广泛扩张的同时,许多LSDV全基因组已经被测序,但是关于LSDV颗粒的蛋白质组成的知识仍然缺失。在这项研究中,通过多步超速离心方法纯化来自菌株KSGP-0240的LSD成熟病毒体(MV)。然后使用无标记鸟枪蛋白质组学分析LSD病毒体的蛋白质组成,基于纳米液相色谱(LC)和串联质谱。该程序导致总共111种LSDV蛋白的鉴定。考虑到这第一个MV蛋白质组超出了包装蛋白,进入了污染物领域,开发了一种分析方法,可以选择66种病毒蛋白作为包装成MV的候选蛋白。将这些病毒蛋白与先前证明为牛痘病毒MV颗粒组成型的蛋白进行比较分析。首次对LSDV菌株进行全面的蛋白质组学分析,这项研究有助于我们了解感染性LSDVMV颗粒的结构特征,并为其他LSDV菌株的进一步系统蛋白质组学表征铺平了道路。重要性块状皮肤病病毒(LSDV)是经济上重要的牛疾病的病原体,该疾病应向世界动物卫生组织通报。在过去的几十年里,这种疾病以惊人的速度在整个非洲大陆蔓延,中东,东欧,俄罗斯联邦,和许多亚洲国家。虽然多个LDSV全基因组使进一步的遗传比较分析成为可能,关于LSDV颗粒的蛋白质组成的知识仍然缺乏。这项研究首次对感染性LSDV颗粒进行了全面的蛋白质组学分析,促使人们为进一步的蛋白质组学LSDV菌株表征做出新的努力。此外,这种首次侵入羊角痘病毒蛋白质组代表了除了唯一的正痘病毒属之外的极少数蛋白质组学研究之一,已经进行了大多数蛋白质组学研究。提供有关其他脊索痘病毒的新信息可能有助于揭示Poxviridae家族中蛋白质组成的新光。