The animal models used in biomedical research cover virtually every human disease. RatDEGdb, a knowledge base of the differentially expressed genes (DEGs) of the rat as a model object in biomedical research is a collection of published data on gene expression in rat strains simulating arterial hypertension, age-related diseases, psychopathological conditions and other human afflictions. The current release contains information on 25,101 DEGs representing 14,320 unique rat genes that change transcription levels in 21 tissues of 10 genetic rat strains used as models of 11 human diseases based on 45 original scientific papers. RatDEGdb is novel in that, unlike any other biomedical database, it offers the manually curated annotations of DEGs in model rats with the use of independent clinical data on equal changes in the expression of homologous genes revealed in people with pathologies. The rat DEGs put in RatDEGdb were annotated with equal changes in the expression of their human homologs in affected people. In its current release, RatDEGdb contains 94,873 such annotations for 321 human genes in 836 diseases based on 959 original scientific papers found in the current PubMed. RatDEGdb may be interesting first of all to human geneticists, molecular biologists, clinical physicians, genetic advisors as well as experts in biopharmaceutics, bioinformatics and personalized genomics. RatDEGdb is publicly available at https://www.sysbio.ru/RatDEGdb.
Животные модели, используемые в биомедицинских исследованиях, в настоящее время охватывают практически весь известный спектр заболеваний человека. База знаний RatDEGdb по дифференциально экспрессирующимся генам (ДЭГ) крысы как модельного объекта в биомедицинских исследованиях представляет собой коллекцию опубликованных данных по экспрессии генов у крыс разных линий, предназначенных для изучения артериальной гипертонии, болезней пожилого возраста, психопатологических состояний и других заболеваний человека. Текущий выпуск RatDEGdb содержит 25 101 ДЭГ, представляющих 14 320 уникальных генов крысы, которые изменяют уровень транскрипции в 21 ткани 10 генетических линий крысы в качестве моделей 11 заболеваний человека согласно 45 оригинальным научным статьям. Новшество RatDEGdb по сравнению с другими биомедицинскими базами данных заключается в курируемой аннотации отклонений ДЭГ крысы как модельного объекта с использованием независимых клинических данных об однонаправленных изменениях экспрессии гомологичных генов, выявленных у людей при различных патологиях. Собранные ДЭГ крыс были аннотированы однонаправленными изменениями экспрессии гомологичных им генов человека у больных людей относительно здоровых. К настоящему времени выпуск RatDEGdb содержит 94 873 такие аннотации для 321 гена человека при 836 заболеваниях согласно 959 оригинальным научным статьям, найденным в текущем выпуске базы данных PubMed. Представленная база знаний может быть интересна в первую очередь специалистам по генетике человека, молекулярным биологам, клиницистам и генетическим консультантам, а также специалистам в области биофармацевтики, биоинформатики и персонализированной геномики. RatDEGdb является общедоступной (https://www.sysbio.ru/RatDEGdb).

According to the WHO, the proportion of people over 60 years is increasing and expected to reach 22% of total world\'s population in 2050. In parallel, recent animal demographic studies have shown that the life expectancy of pet dogs and cats is increasing. Brain aging is associated not only with molecular and morphological changes but also leads to different degrees of behavioral and cognitive dysfunction. Common age-related brain lesions in humans include brain atrophy, neuronal loss, amyloid plaques, cerebrovascular amyloid angiopathy, vascular mineralization, neurofibrillary tangles, meningeal osseous metaplasia, and accumulation of lipofuscin. In aging humans, the most common neurodegenerative disorder is Alzheimer\'s disease (AD), which progressively impairs cognition, behavior, and quality of life. Pathologic changes comparable to the lesions of AD are described in several other animal species, although their clinical significance and effect on cognitive function are poorly documented. This review describes the commonly reported age-associated neurologic lesions in domestic and laboratory animals and the relationship of these lesions to cognitive dysfunction. Also described are the comparative interspecies similarities and differences to AD and other human neurodegenerative diseases including Parkinson\'s disease and progressive supranuclear palsy, and the spontaneous and transgenic animal models of these diseases.

Animal models are indispensible in biomedical research and have made tremendous contributions to answer fundamental questions on human biology, disease mechanisms, and to the development of new drugs and diagnostic tools. Due to the limitations of rodent models in translational medicine, tree shrews (Tupaia belangeri chinensis), the closest relative of primates, have attracted increasing attention in modeling human diseases and therapeutic responses. Here we discuss the recent progress in tree shrew biology and the development of tree shrews as human disease models including infectious diseases, metabolic diseases, neurological and psychiatric diseases, and cancers. Meanwhile, the current problems and future perspectives of the tree shrew model are explored.
动物模型在生物医学领域(如回答人体各种重大生物学问题、解析人类疾病机理和新药研发等方面)已经做出了不可替代的巨大贡献。转化医学存在的问题使得树鼩 (Tupaia belangeri chinensis) 实验动物重新得到重视;人类疾病的树鼩模型也再次受到越来越多的关注。该文综述了国内外特别是近年来我国树鼩研究进展, 包括树鼩基础生物学及动物模型方面取得的成绩, 并分析了该领域目前存在的困难和问题, 探讨了未来的一些研究方向。