Abstract：
OBJECTIVE: Describe the structure of pathogenic germline variants and clinical and anatomical features in colorectal cancer patients in Moscow.
METHODS: The whole genome sequencing results of patients with suspected hereditary cancer syndrome were evaluated. All identified genetic variants were validated using Sanger sequencing.
RESULTS: The study included 238 patients with colorectal cancer, 41/238 (17.2%) patients have pathogenic germline variants associated with hereditary cancer syndromes or increased cancer risk. Lynch syndrome accounts for 8% of all colorectal cancer cases (19/238), and familial adenomatous polyposis - 1.7% (4/238). 5 new genetic variants were described for the first time in a Russian colorectal cancer patients: MLH1 c.1921dup (p.Leu641fs), APC c.2929C>T (p.Gln977Ter), PMS2 c.327del (p.Ala110LeufsTer2), MSH2 c.1857dup (p. Val620CysfsTer24), ATM c.895G>T (p.Glu299Ter). In 197 of 238 patients, no significant variants were identified or variants with an uncertain clinical underlying cause were identified.
CONCLUSIONS: According to the results of the study, an earlier manifestation of a malignant neoplasm and a more frequent occurrence of high-grade carcinomas in the presence of pathogenic germline mutations were noted compared to the group of patients without clinically significant varianrs, while in the group with identified mutations, the frequency of regional and distant metastasis was not increased.
UNASSIGNED: Описание структуры патогенных герминальных вариантов при колоректальном раке в выборке пациентов Москвы.
UNASSIGNED: Проведена оценка результатов полногеномного секвенирования ДНК пациентов с колоректальным раком с подозрением на наследственный опухолевый синдром. Все выявленные генетические варианты валидированы с помощью секвенирования по Сэнгеру.
UNASSIGNED: В исследование включены 238 пациентов с диагностированным колоректальным раком, из них у 41 (17,2%) выявлены патогенные герминальные варианты, ассоциированные с наследственными опухолевыми синдромами или повышенным риском развития злокачественных новообразований, из них на синдром Линча приходится 8% всех случаев колоректального рака в исследуемой выборке (19/238), а на аденоматозный полипозный синдром — 1,7% (4/238). Впервые описано 5 новых генетических вариантов в российской выборке пациентов: MLH1 c.1921dup (p.Leu641fs), APC c.2929C>T (p.Gln977Ter), PMS2 c.327del (p.Ala110LeufsTer2), MSH2 c.1857dup (p.Val620CysfsTer24), ATM c.895G>T (p.Glu299Ter). У 197 из 238 пациентов не обнаружено клинически значимых вариантов или выявлены варианты с неопределенной клинической значимостью.
UNASSIGNED: По результатам исследования отмечена более ранняя манифестация злокачественного новообразования и более частая встречаемость карцином высокой степени злокачественности при наличии патогенных герминальных мутаций по сравнению с группой пациентов без клинически значимых мутаций, при этом в группе с выявленными мутациями частота регионарного и отдаленного метастазирования не повышена.
METHODS: The whole genome sequencing results of patients with suspected hereditary cancer syndrome were evaluated. All identified genetic variants were validated using Sanger sequencing.
RESULTS: The study included 238 patients with colorectal cancer, 41/238 (17.2%) patients have pathogenic germline variants associated with hereditary cancer syndromes or increased cancer risk. Lynch syndrome accounts for 8% of all colorectal cancer cases (19/238), and familial adenomatous polyposis - 1.7% (4/238). 5 new genetic variants were described for the first time in a Russian colorectal cancer patients: MLH1 c.1921dup (p.Leu641fs), APC c.2929C>T (p.Gln977Ter), PMS2 c.327del (p.Ala110LeufsTer2), MSH2 c.1857dup (p. Val620CysfsTer24), ATM c.895G>T (p.Glu299Ter). In 197 of 238 patients, no significant variants were identified or variants with an uncertain clinical underlying cause were identified.
CONCLUSIONS: According to the results of the study, an earlier manifestation of a malignant neoplasm and a more frequent occurrence of high-grade carcinomas in the presence of pathogenic germline mutations were noted compared to the group of patients without clinically significant varianrs, while in the group with identified mutations, the frequency of regional and distant metastasis was not increased.
UNASSIGNED: Описание структуры патогенных герминальных вариантов при колоректальном раке в выборке пациентов Москвы.
UNASSIGNED: Проведена оценка результатов полногеномного секвенирования ДНК пациентов с колоректальным раком с подозрением на наследственный опухолевый синдром. Все выявленные генетические варианты валидированы с помощью секвенирования по Сэнгеру.
UNASSIGNED: В исследование включены 238 пациентов с диагностированным колоректальным раком, из них у 41 (17,2%) выявлены патогенные герминальные варианты, ассоциированные с наследственными опухолевыми синдромами или повышенным риском развития злокачественных новообразований, из них на синдром Линча приходится 8% всех случаев колоректального рака в исследуемой выборке (19/238), а на аденоматозный полипозный синдром — 1,7% (4/238). Впервые описано 5 новых генетических вариантов в российской выборке пациентов: MLH1 c.1921dup (p.Leu641fs), APC c.2929C>T (p.Gln977Ter), PMS2 c.327del (p.Ala110LeufsTer2), MSH2 c.1857dup (p.Val620CysfsTer24), ATM c.895G>T (p.Glu299Ter). У 197 из 238 пациентов не обнаружено клинически значимых вариантов или выявлены варианты с неопределенной клинической значимостью.
UNASSIGNED: По результатам исследования отмечена более ранняя манифестация злокачественного новообразования и более частая встречаемость карцином высокой степени злокачественности при наличии патогенных герминальных мутаций по сравнению с группой пациентов без клинически значимых мутаций, при этом в группе с выявленными мутациями частота регионарного и отдаленного метастазирования не повышена.
摘要：
暂无翻译
