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Abstract：
OBJECTIVE: Typhoid fever is a life-threatening disease caused by Salmonella enterica serovar Typhi, resulting in a significant disease burden across developing countries. Historically, China was very much close to the global epicenter of typhoid, but the role of typhoid transmission within China and among epicenter remains overlooked in previous investigations. By using newly produced genomics on a national scale, we clarify the complex local and global transmission history of such a notorious disease agent in China spanning the most recent five decades, which largely undermines the global public health network.
摘要：
伤寒,由伤寒沙门氏菌（S.Typhi),是一种威胁生命的疾病，通常是食源性的，通常与国际旅行有关。这种疾病传播在许多低收入和中等收入国家仍然很普遍，代表了新的全球疫情的进一步热点。中国历来受到伤寒的影响,但是本地传输和输入各自的作用仍然未知。这里,我们制作了一份全国范围的中国伤寒负担图，并调查了伤寒疾病之间的关联，气候和各种社会经济参数。要评估变速器动态，我们对中国境内分离的伤寒沙门氏菌进行了50年的子采样，并对其基因组进行了测序。由此产生的705个新基因组，以来自六大洲87个国家的5190个全球分离株为背景，导致发现了属于进化枝2.1/2.3/3.2/4.3的几个主要的内陆中国克隆。这些克隆与来自海外的多次引进有关，其次是局部扩张。值得注意的是,4.3.1中国东部的分离株与中国西北部的分离株在基因上不接近，但与国际分离株接近，表明他们与国际旅行的联系。额外的体外试验表明，4.3.1阐述了更好的细胞内存活，耐酸性,和其他谱系的干燥耐受性，部分解释了它的成功。第一次,我们已经调查了中国的伤寒传播，寻找当地的传播和进口，这可以指导伤寒防治政策。重要性伤寒是由伤寒沙门氏菌引起的危及生命的疾病，导致发展中国家的重大疾病负担。历史上,中国非常接近全球伤寒的震中，但是伤寒在中国和震中传播的作用在以前的调查中仍然被忽视。通过在全国范围内使用新产生的基因组学，我们澄清了这种臭名昭著的病原体在中国最近五十年的复杂的局部和全球传播史，这在很大程度上破坏了全球公共卫生网络。
