{Reference Type}: English Abstract
{Title}: [In silico analysis of molecular mimicry between human aquaporin 3, Aspergillus fumigatus aquaporin and aquaporins from allergic sources].
{Author}: Sánchez A;Padilla Y;Lorduy A;Sánchez J;Múnera M;Baena C;Bernal C;Urrego J;
{Journal}: Rev Alerg Mex
{Volume}: 71
{Issue}: 1
{Year}: 2024 Feb 1
暂无{DOI}: 10.29262/ram.v71i1.1370
{Abstract}: <B>OBJECTIVE: </B>Conduct an in-silico assessment of potential molecular mimicry between human aquaporins, A. fumigatus, and diverse allergenic sources.<BR><B>METHODS: </B>Amino acid sequences of human AQP3 and A. fumigatus aquaporin were compared through multiple alignments with 25 aquaporins from diverse allergenic sources. Phylogenetic analysis and homology-based modeling were executed, and the ElliPro server predicted conserved antigenic regions on 3D structures.<BR><B>RESULTS: </B>Global identity among studied aquaporins was 32.6%, with a specific conserved local region at 71.4%. Five monophyletic clades (A-E) were formed, and Group B displayed the highest identity (95%), including 6 mammalian aquaporins, notably AQP3. A. fumigatus aquaporin exhibited the highest identity with Malassezia sympodialis (35%). Three linear and three discontinuous epitopes were identified in both human and A. fumigatus aquaporins. The Root Mean Square Deviation (RMSD) from overlapping aquaporin structures was 1.006.<BR><B>CONCLUSIONS: </B>Identification of potential linear and conformational epitopes on human AQP3 suggests likely molecular mimicry with A. fumigatus aquaporins. High identity in a specific antigenic region indicates potential autoreactivity and a probable antigenic site involved in cross-reactivity. Validation through in vitro and in vivo studies is essential for further understanding and confirmation.<BR><B>OBJECTIVE: </B>Realizar una evaluación in silico del posible mimetismo molecular entre las acuaporinas humanas, A. fumigatus y diversas fuentes alergénicas.<BR><B>UNASSIGNED: </B>Se compararon secuencias de aminoácidos de AQP3 humana y acuaporina de A. fumigatus mediante alineamientos múltiples con 25 acuaporinas de diversas fuentes alergénicas. Se ejecutaron análisis filogenéticos y modelos basados en homología, y el servidor ElliPro predijo regiones antigénicas preservadas en estructuras 3D.<BR><B>RESULTS: </B>La identidad global entre las acuaporinas estudiadas fue del 32.6%, con una región local específica preservada en el 71.4%. Se formaron cinco clados monofiléticos (A-E), y el grupo B mostró la identidad más alta (95%), incluidas 6 acuaporinas de mamíferos, en particular AQP3. A. fumigatus aquaporin exhibió la mayor identidad con Malassezia sympodialis (35%). Se identificaron tres epítopos lineales y tres discontinuos en acuaporinas tanto humanas como de A. fumigatus. La desviación cuadrática media (RMSD) de las estructuras de acuaporinas superpuestas fue de 1,006.<BR><B>UNASSIGNED: </B>La identificación de posibles epítopos lineales y conformacionales en AQP3 humano sugiere un probable mimetismo molecular con acuaporinas de A. fumigatus. La identidad alta en una región antigénica específica indica autorreactividad potencial y un sitio antigénico probable implicado en la reactividad cruzada. La validación mediante estudios in vitro e in vivo es desicivo para una mayor comprensión y confirmación.