%0 Journal Article
%T [Concordance of DNA fragmentation times for next-generation sequencing library construction based on DNA electrophoresis rating method and Nano/Qubit ratio method].
%A Gao J
%A Liu TQ
%A Lu T
%J Zhonghua Bing Li Xue Za Zhi
%V 53
%N 8
%D 2024 Aug 8
%M 39103271
暂无%R 10.3760/cma.j.cn112151-20231211-00402
%X 目的： 评价电泳评级法及Nano/Qubit浓度比值法在二代测序建库DNA片段化过程中超声打断时间的一致性。 方法： 收集中国医学科学院 北京协和医学院 北京协和医院病理科323例石蜡固定样本。分别通过DNA电泳评级法和Nano/Qubit浓度比值法确定二代测序建库DNA片段化过程中的超声打断时间，利用Kappa一致性检验对二者的一致性进行比较。 结果： Kappa系数表明电泳评级法与Nano/Qubit浓度比值法2种方法评估DNA超声打断时间的一致性良好（Kappa=0.540，P<0.05），但对于低质量标本，缺乏一致性：Nano/Qubit值>7.5（Kappa=0.021，P=0.751）或D级（Kappa=0.040，P=0.146）。 结论： 电泳评级法与Nano/Qubit浓度比值评估二代测序文库DNA片段化时间的一致性良好，可以用Nano/Qubit值大致推算标本的质量，但对于Nano/Qubit值>7.5的标本，应当通过电泳评级法进行评估。.