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Abstract：
The aim of this study was to investigate and characterize the microbiome in bile samples obtained from dogs with gallbladder mucocele (6), cats with suspected cholangitis/cholangiohepatitis (4), as well as from healthy dogs (6) and cats (4). Our goal was to compare the microbiome patterns with clinical findings and bacterial culture results in diseases of the gallbladder and to identify a potential microbial biomarker of diseased groups. The microbial taxa composition revealed that Proteobacteria were the most dominant phylum in healthy and diseased individuals in all groups. Individuals from six families including Burkholderiaceae, Phyllobacteriaceae, Bradyrhizobiaceae, Sphingomonadaceae, Moraxellaceae, and Caulobacteraceae, constituted the core microbiome in the gallbladder of healthy dogs. A combination of LEfSe analysis and Taxa2ASV decomposer revealed that Pseudomonaceae and Ruminococcaceae exclusively occurred in the mucocele group. In conclusion, this study determined the core microbiome in the gallbladder of healthy dogs and the possible biomarkers (Pseudomonaceae and Ruminococcaceae) of gallbladder mucocele in dogs.
Le but de cette étude était d’étudier et de caractériser le microbiome dans des échantillons de bile obtenus auprès de chiens atteints de mucocèle de la vésicule biliaire (6), de chats suspectés de cholangite/cholangiohépatite (4), ainsi que de chiens (6) et de chats en bonne santé (4). Notre objectif était de comparer les modèles de microbiome avec les résultats cliniques et les résultats de cultures bactériennes dans les maladies de la vésicule biliaire et d’identifier un biomarqueur microbien potentiel des groupes malades. La composition des taxons microbiens a révélé que les protéobactéries constituaient le phylum le plus dominant chez les individus sains et malades de tous les groupes. Des individus de six familles, dont Burkholderiaceae, Phyllobacteriaceae, Bradyrhizobiaceae, Sphingomonadaceae, Moraxellaceae et Caulobacteraceae, constituaient le microbiome central de la vésicule biliaire de chiens en bonne santé. Une combinaison de l’analyse LEfSe et du décomposeur Taxa2ASV a révélé que les Pseudomonaceae et les Ruminococcaceae étaient exclusivement présentes dans le groupe des mucocèles. En conclusion, cette étude a déterminé le microbiome central de la vésicule biliaire de chiens en bonne santé et les biomarqueurs possibles (Pseudomonaceae et Ruminococcaceae) de la mucocèle de la vésicule biliaire chez le chien.(Traduit par Docteur Serge Messier).
Le but de cette étude était d’étudier et de caractériser le microbiome dans des échantillons de bile obtenus auprès de chiens atteints de mucocèle de la vésicule biliaire (6), de chats suspectés de cholangite/cholangiohépatite (4), ainsi que de chiens (6) et de chats en bonne santé (4). Notre objectif était de comparer les modèles de microbiome avec les résultats cliniques et les résultats de cultures bactériennes dans les maladies de la vésicule biliaire et d’identifier un biomarqueur microbien potentiel des groupes malades. La composition des taxons microbiens a révélé que les protéobactéries constituaient le phylum le plus dominant chez les individus sains et malades de tous les groupes. Des individus de six familles, dont Burkholderiaceae, Phyllobacteriaceae, Bradyrhizobiaceae, Sphingomonadaceae, Moraxellaceae et Caulobacteraceae, constituaient le microbiome central de la vésicule biliaire de chiens en bonne santé. Une combinaison de l’analyse LEfSe et du décomposeur Taxa2ASV a révélé que les Pseudomonaceae et les Ruminococcaceae étaient exclusivement présentes dans le groupe des mucocèles. En conclusion, cette étude a déterminé le microbiome central de la vésicule biliaire de chiens en bonne santé et les biomarqueurs possibles (Pseudomonaceae et Ruminococcaceae) de la mucocèle de la vésicule biliaire chez le chien.(Traduit par Docteur Serge Messier).
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