La recherche médicale recourt à des données de plus en plus massives, complexes et interdépendantes dont l’analyse nécessite l’usage d’algorithmes spécialisés. Afin de reproduire et valider les résultats d’une étude scientifique de manière indépendante, il n’est, dès lors, plus suffisant de partager le texte de l’article en «open-access» complété avec les données brutes en «open-data». Il convient désormais d’également partager les algorithmes qui ont servi à l’analyse des données avec d’autres équipes de chercheurs. Le logiciel libre et «open-source» répond précisément à ce besoin de diffuser les connaissances techniques à grande échelle. Dans cet article, nous présentons plusieurs exemples de logiciels libres utilisés en médecine, avec une attention particulière portée à l’imagerie médicale.